四合院除了內宅、外宅的主要院落之外，還會形成一些小的院子，如正房兩旁耳房前的小院，以及外院兩側被屏門隔開的小院。

　　內宅的院落中有正南北十字形的甬道，老北京的住戶大多會在院子里栽上樹，除了松樹、柏樹和楊樹等因為多種在墳地而不能栽種外，其他各種樹木都有種植，過去北京有民諺：“桑松柏梨槐，不進府王宅”，說的就是在庭院種樹的禁忌。比較常見的樹木有棗樹、柿樹等，花木主要有牡丹、芍藥、玉蘭、丁香、海棠、紫藤、石榴等，在四合院內種棗樹、石榴樹寓意“早”生貴子、多子多孫，種柿樹表示事事如意，種丁香、海棠，表示主人有身份和有一定的文化修養。

　　此外民間還有養魚的習俗，多用直徑為60到70厘米的魚缸養著各色的魚并種著荷花，冬天魚缸還能用來存放食品。

　　夏天時分，天氣炎熱，還可在庭院中搭設天棚遮陽，老北京有“天棚魚缸石榴樹，先生肥狗胖丫頭”的俗語，就是家住北京的書吏人家的生活寫照。